Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ly6dP35459 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ly6dP35459 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ly6dP35459 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ly6dP35459 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ly6dP35459 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ly6dP35459 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ly6dP35459 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ly6dP35459 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ly6dP35459 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ly6dP35459 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ly6dP35459 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms