Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sftpa1P35242 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sftpa1P35242 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sftpa1P35242 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sftpa1P35242 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sftpa1P35242 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sftpa1P35242 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sftpa1P35242 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sftpa1P35242 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sftpa1P35242 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sftpa1P35242 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sftpa1P35242 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sftpa1P35242 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sftpa1P35242 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sftpa1P35242 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sftpa1P35242 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sftpa1P35242 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sftpa1P35242 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sftpa1P35242 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sftpa1P35242 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sftpa1P35242 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sftpa1P35242 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sftpa1P35242 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sftpa1P35242 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sftpa1P35242 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sftpa1P35242 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sftpa1P35242 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sftpa1P35242 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sftpa1P35242 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms