Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ptpn11P35235 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptpn11P35235 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ptpn11P35235 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ptpn11P35235 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Ptpn11P35235 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptpn11P35235 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptpn11P35235 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptpn11P35235 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptpn11P35235 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptpn11P35235 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptpn11P35235 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms