Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pola1P33609 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pola1P33609 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pola1P33609 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pola1P33609 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pola1P33609 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pola1P33609 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Pola1P33609 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pola1P33609 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pola1P33609 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pola1P33609 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms