Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd1P33215 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms