Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdh15P33146 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms