Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxa11P31311 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxa11P31311 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxa11P31311 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxa11P31311 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxa11P31311 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxa11P31311 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxa11P31311 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxa11P31311 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa11P31311 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms