Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccnd3P30282 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccnd3P30282 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccnd3P30282 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms