Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VtnP29788 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VtnP29788 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VtnP29788 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VtnP29788 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VtnP29788 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VtnP29788 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VtnP29788 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VtnP29788 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VtnP29788 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VtnP29788 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VtnP29788 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VtnP29788 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VtnP29788 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VtnP29788 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VtnP29788 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VtnP29788 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VtnP29788 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VtnP29788 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VtnP29788 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VtnP29788 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VtnP29788 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VtnP29788 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VtnP29788 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VtnP29788 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VtnP29788 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VtnP29788 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VtnP29788 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VtnP29788 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VtnP29788 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VtnP29788 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VtnP29788 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VtnP29788 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VtnP29788 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VtnP29788 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VtnP29788 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VtnP29788 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VtnP29788 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VtnP29788 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VtnP29788 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VtnP29788 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VtnP29788 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VtnP29788 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VtnP29788 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VtnP29788 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VtnP29788 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VtnP29788 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VtnP29788 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VtnP29788 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VtnP29788 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VtnP29788 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VtnP29788 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VtnP29788 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VtnP29788 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VtnP29788 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VtnP29788 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VtnP29788 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VtnP29788 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VtnP29788 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VtnP29788 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VtnP29788 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VtnP29788 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VtnP29788 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VtnP29788 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VtnP29788 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VtnP29788 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VtnP29788 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VtnP29788 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VtnP29788 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VtnP29788 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VtnP29788 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VtnP29788 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VtnP29788 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VtnP29788 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VtnP29788 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VtnP29788 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VtnP29788 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VtnP29788 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VtnP29788 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VtnP29788 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VtnP29788 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VtnP29788 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VtnP29788 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VtnP29788 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VtnP29788 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VtnP29788 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VtnP29788 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VtnP29788 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VtnP29788 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VtnP29788 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VtnP29788 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VtnP29788 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VtnP29788 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VtnP29788 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VtnP29788 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VtnP29788 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VtnP29788 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VtnP29788 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VtnP29788 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VtnP29788 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms