Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vcam1P29533 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms