Protein–RNA interactions for Protein: P28650

Adssl1, Adenylosuccinate synthetase isozyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Adssl1P28650 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Adssl1P28650 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Adssl1P28650 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Adssl1P28650 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Adssl1P28650 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Adssl1P28650 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Adssl1P28650 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Adssl1P28650 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Adssl1P28650 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
Adssl1P28650 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Adssl1P28650 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Adssl1P28650 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Adssl1P28650 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Adssl1P28650 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Adssl1P28650 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Adssl1P28650 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Adssl1P28650 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Adssl1P28650 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Adssl1P28650 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Adssl1P28650 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Adssl1P28650 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Adssl1P28650 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Adssl1P28650 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Adssl1P28650 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Adssl1P28650 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Adssl1P28650 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Adssl1P28650 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Adssl1P28650 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Adssl1P28650 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Adssl1P28650 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Adssl1P28650 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Adssl1P28650 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Adssl1P28650 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Adssl1P28650 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Adssl1P28650 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Adssl1P28650 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Adssl1P28650 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms