Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dusp1P28563 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dusp1P28563 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms