Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd10P28359 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxd10P28359 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms