Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd9P28357 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd9P28357 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms