Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv4P28322 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv4P28322 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv4P28322 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Etv4P28322 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Etv4P28322 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Etv4P28322 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Etv4P28322 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Etv4P28322 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Etv4P28322 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv4P28322 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Etv4P28322 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv4P28322 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv4P28322 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv4P28322 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv4P28322 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms