Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-DMaP28078 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-DMaP28078 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms