Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vav1P27870 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vav1P27870 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vav1P27870 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vav1P27870 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms