Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms