Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af2P26369 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2af2P26369 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2af2P26369 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2af2P26369 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
U2af2P26369 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af2P26369 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af2P26369 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af2P26369 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2af2P26369 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms