Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnna1P26231 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms