Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra3P26049 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra3P26049 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra3P26049 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra3P26049 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra3P26049 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra3P26049 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra3P26049 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra3P26049 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra3P26049 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra3P26049 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra3P26049 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra3P26049 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra3P26049 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra3P26049 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra3P26049 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra3P26049 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra3P26049 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra3P26049 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra3P26049 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra3P26049 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra3P26049 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra3P26049 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra3P26049 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra3P26049 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra3P26049 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra3P26049 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra3P26049 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms