Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou2f1P25425 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou2f1P25425 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou2f1P25425 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou2f1P25425 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou2f1P25425 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou2f1P25425 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pou2f1P25425 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms