Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfrsf1bP25119 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf1bP25119 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms