Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gria1P23818 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gria1P23818 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gria1P23818 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria1P23818 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria1P23818 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gria1P23818 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gria1P23818 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gria1P23818 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gria1P23818 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms