Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ggta1P23336 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ggta1P23336 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ggta1P23336 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ggta1P23336 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ggta1P23336 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ggta1P23336 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ggta1P23336 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ggta1P23336 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ggta1P23336 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ggta1P23336 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ggta1P23336 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms