Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja1P23242 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja1P23242 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja1P23242 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja1P23242 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gja1P23242 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gja1P23242 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gja1P23242 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms