Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd3eP22646 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms