Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk1P22518 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk1P22518 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk1P22518 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk1P22518 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk1P22518 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk1P22518 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk1P22518 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clk1P22518 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk1P22518 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk1P22518 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms