Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Myo5bP21271 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myo5bP21271 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms