Protein–RNA interactions for Protein: P20826

Kitlg, Kit ligand, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KitlgP20826 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
KitlgP20826 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KitlgP20826 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KitlgP20826 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KitlgP20826 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KitlgP20826 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KitlgP20826 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KitlgP20826 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KitlgP20826 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KitlgP20826 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KitlgP20826 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KitlgP20826 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KitlgP20826 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KitlgP20826 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KitlgP20826 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KitlgP20826 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KitlgP20826 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KitlgP20826 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KitlgP20826 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KitlgP20826 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KitlgP20826 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KitlgP20826 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KitlgP20826 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KitlgP20826 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms