Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms