Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ms4a2P20490 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a2P20490 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms