Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P20040 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P20040 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P20040 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P20040 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P20040 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
P20040 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P20040 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P20040 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P20040 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P20040 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
P20040 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P20040 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P20040 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P20040 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P20040 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P20040 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P20040 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P20040 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P20040 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P20040 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P20040 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P20040 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P20040 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P20040 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P20040 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P20040 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P20040 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P20040 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P20040 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P20040 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P20040 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P20040 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P20040 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P20040 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P20040 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P20040 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P20040 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
P20040 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P20040 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P20040 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
P20040 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
P20040 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P20040 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P20040 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P20040 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P20040 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P20040 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P20040 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P20040 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P20040 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P20040 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P20040 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P20040 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P20040 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P20040 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P20040 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P20040 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P20040 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P20040 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P20040 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P20040 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P20040 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P20040 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P20040 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P20040 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P20040 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P20040 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
P20040 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
P20040 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P20040 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P20040 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P20040 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P20040 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P20040 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P20040 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P20040 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P20040 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P20040 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P20040 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P20040 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P20040 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P20040 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P20040 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P20040 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P20040 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P20040 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P20040 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P20040 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P20040 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P20040 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P20040 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P20040 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P20040 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P20040 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P20040 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P20040 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P20040 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P20040 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P20040 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms