Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cox5bP19536 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cox5bP19536 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cox5bP19536 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cox5bP19536 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cox5bP19536 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cox5bP19536 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cox5bP19536 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cox5bP19536 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cox5bP19536 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cox5bP19536 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cox5bP19536 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cox5bP19536 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cox5bP19536 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cox5bP19536 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cox5bP19536 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cox5bP19536 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cox5bP19536 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cox5bP19536 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cox5bP19536 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cox5bP19536 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cox5bP19536 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms