Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms