Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cxcl9P18340 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cxcl9P18340 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl9P18340 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms