Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PcnaP17918 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PcnaP17918 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PcnaP17918 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PcnaP17918 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PcnaP17918 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PcnaP17918 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PcnaP17918 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PcnaP17918 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PcnaP17918 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PcnaP17918 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PcnaP17918 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PcnaP17918 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PcnaP17918 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PcnaP17918 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PcnaP17918 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PcnaP17918 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PcnaP17918 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PcnaP17918 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PcnaP17918 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PcnaP17918 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PcnaP17918 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PcnaP17918 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PcnaP17918 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PcnaP17918 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PcnaP17918 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms