Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Defa-rs1P17533 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs1P17533 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms