Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Sptan1P16546 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms