Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra6P16305 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra6P16305 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms