Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp53P15975 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp53P15975 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp53P15975 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp53P15975 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp53P15975 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp53P15975 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp53P15975 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp53P15975 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp53P15975 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp53P15975 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp53P15975 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp53P15975 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms