Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr4a1P12813 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms