Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrm1P12657 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrm1P12657 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms