Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga5P11688 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga5P11688 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga5P11688 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga5P11688 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga5P11688 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga5P11688 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga5P11688 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga5P11688 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga5P11688 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga5P11688 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms