Protein–RNA interactions for Protein: P11672

Lcn2, Neutrophil gelatinase-associated lipocalin, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn2P11672 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lcn2P11672 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lcn2P11672 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms