Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DmdP11531 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DmdP11531 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DmdP11531 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DmdP11531 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DmdP11531 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DmdP11531 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DmdP11531 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DmdP11531 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DmdP11531 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DmdP11531 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DmdP11531 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DmdP11531 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DmdP11531 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DmdP11531 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DmdP11531 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DmdP11531 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DmdP11531 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DmdP11531 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DmdP11531 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DmdP11531 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DmdP11531 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DmdP11531 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DmdP11531 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DmdP11531 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DmdP11531 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DmdP11531 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DmdP11531 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DmdP11531 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DmdP11531 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DmdP11531 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DmdP11531 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DmdP11531 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DmdP11531 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DmdP11531 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
DmdP11531 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DmdP11531 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DmdP11531 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DmdP11531 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DmdP11531 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DmdP11531 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DmdP11531 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DmdP11531 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DmdP11531 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DmdP11531 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DmdP11531 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DmdP11531 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DmdP11531 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DmdP11531 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DmdP11531 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DmdP11531 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DmdP11531 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DmdP11531 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DmdP11531 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DmdP11531 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DmdP11531 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DmdP11531 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DmdP11531 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DmdP11531 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DmdP11531 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DmdP11531 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DmdP11531 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DmdP11531 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DmdP11531 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DmdP11531 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DmdP11531 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DmdP11531 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DmdP11531 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DmdP11531 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DmdP11531 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DmdP11531 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DmdP11531 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DmdP11531 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DmdP11531 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DmdP11531 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DmdP11531 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DmdP11531 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DmdP11531 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DmdP11531 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DmdP11531 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DmdP11531 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DmdP11531 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DmdP11531 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DmdP11531 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DmdP11531 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DmdP11531 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DmdP11531 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DmdP11531 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DmdP11531 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DmdP11531 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DmdP11531 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DmdP11531 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DmdP11531 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DmdP11531 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DmdP11531 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DmdP11531 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DmdP11531 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DmdP11531 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DmdP11531 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DmdP11531 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms