Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd4P10628 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms