Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsbP10605 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsbP10605 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsbP10605 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsbP10605 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsbP10605 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsbP10605 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsbP10605 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsbP10605 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsbP10605 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms