Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd8bP10300 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms