Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myod1P10085 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myod1P10085 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myod1P10085 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myod1P10085 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myod1P10085 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myod1P10085 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms